Linux fürtözés HOGYAN

Ram Samudrala (me@ram.org)

   v1.1, 2003 június 17.
     _________________________________________________________________

   Hogyan készítsünk nagy teljesítményû Linux fürtöket.
     _________________________________________________________________

1. Bevezetés

   Ez a dokumentum leírja hogyan készítettem el a [1]kutatásaimhoz
   szükséges nagy teljesítményû Linux fürtöket.

   Az alábbi információkat a saját felelõsségedre használd. Nem vállalok
   felelõseget semmilyen cselekedetedért, amelyet ezen HOGYAN
   elolvasására alapozol. Eme HOGYAN legfrissebb változata megtalálható a
   [2]http://www.ram.org/computing/linux/linux_cluster.html honlapon.

   Szemben más dokumentumokkal, melyek általában beszélnek arról hogyan
   kell fürtöket készíteni, ez egy specifikus leírás arról, hogy a mi
   laborunk miként készítette el azt. Így nem csak a számítási szempontok
   részleteit, hanem az asztali számítógép, laptop, és a szerver
   általános szempontjait is tartalmazza. A dokumentum fõleg belsõ
   használatra készült, de feltettem webre is, mivel számos e-mail-t
   kaptam amik ugyanezekrõl az információkról érdeklõdnek. Mostanában -
   ahogy egy másik 64 csomópontos fürtöt tervezetem - azt találtam, hogy
   nincs információ arról, pontosan hogyan gyûjthetsz össze olyan
   komponenseket amibõl Linux alatt megbízhatóan mûködõ csomópontokat
   hozhatsz létre. Olyan információ ami nem csak a csomópontokkal
   történõ számítást, hanem azok szükségleteit is tartalmazza. Leginkább
   arra használható ez a HOGYAN, hogy bemutassa milyen típusú hardverek
   mûködnek jól Linux alatt és milyenek nem.

2. Hardver

   Ez a fejezet a hardver választásommal foglalkozik. Az [3]ismert
   hardver problémák fejezetet leszámítva feltettem, hogy minden tényleg
   jól mûködik.

   A hardver telepítése egyszerû, a legtöbb részlet benne van a
   kézikönyvben. Minden részben a hardverlista a megrendelés sorrendjében
   található (a legújabb a legelsõ).

2.1 Csomópont hardverek

   32 db gép az alábbi összeállítással rendelkezik:

     * 2 XEON 2.4GHZ 533FSB CPU
     * Supermicro X5DPR-1G2 alaplap
     * 2 512MB PC2100 DDR REG ECC RAM
     * 1 40GB SEA 7200 HD
     * 1 120GB SEA 7200 HD
     * Supermicro Slim 24X CDROM
     * CSE-812 400 C/B 1U doboz

   32 db gép az alábbi összeállítással rendelkezik:

     * 2 AMD Palamino MP XP 2000+ 1.67 GHz CPU
     * Asus A7M266-D w/LAN Dual DDR alaplap
     * 2 Kingston 512mb PC2100 DDR-266MHz REG ECC RAM
     * 1 41 GB Maxtor 7200rpm ATA100 HD
     * 1 120 GB Maxtor 5400rpm ATA100 HD
     * Asus CD-A520 52x CDROM
     * 1.44mb floppy meghajtó
     * ATI Expert 2000 Rage 128 32mb
     * IN-WIN P4 300ATX Mid torony ház
     * Enermax P4-430ATX tápegység

   32 db gép az alábbi összeállítással rendelkezik:

     * 2 AMD Palamino MP XP 1800+ 1.53 GHz CPU
     * Tyan S2460 Dual Socket-A/MP alaplap
     * Kingston 512mb PC2100 DDR-266MHz REG ECC RAM
     * 1 20 GB Maxtor UDMA/100 7200rpm HD
     * 1 120 GB Maxtor 5400rpm ATA100 HD
     * Asus CD-A520 52x CDROM
     * 1.44mb floppy meghajtó
     * ATI Expert 98 8mb AGP monitorvezérlõ
     * IN-WIN P4 300ATX Mid torony ház
     * Intel PCI PRO-100 10/100Mbps hálózati kártya
     * Enermax P4-430ATX tápegység

   32 db gép az alábbi összeállítással rendelkezik:

     * 2 Pentium III 1 GHz Intel CPU
     * Supermicro 370 DLE Dual PIII-FCPGA alaplap
     * 2 256 MB 168-pin PC133 Registered ECC Micron RAM
     * 1 20 GB Maxtor ATA/66 5400 RPM HD
     * 1 40 GB Maxtor UDMA/100 7200 RPM HD
     * Asus CD-S500 50x CDROM
     * 1.4 MB floppy meghajtó
     * ATI Expert 98 8 MB PCI monitorvezérlõ
     * IN-WIN P4 300ATX Mid torony ház

2.2 Szerver hardver

   1 db szerver külsõ használatra (információ terjesztés) az alábbi
   összeállítással rendelkezik:

     * 2 AMD Palamino MP XP 2000+ 1.67 GHz CPU
     * Asus A7M266-D w/LAN Dual DDR
     * 4 Kingston 512mb PC2100 DDR-266MHz REG ECC RAM
     * Asus CD-A520 52x CDROM
     * 1 41 GB Maxtor 7200rpm ATA100 HD
     * 6 120 GB Maxtor 5400rpm ATA100 HD
     * 1.44mb floppy meghajtó
     * ATI Expert 2000 Rage 128 32mb
     * IN-WIN P4 300ATX Mid torony ház
     * Enermax P4-430ATX tápegység

2.3 Asztali számítógép hardver

   1 db asztali számítógép az alábbi összeállítással rendelkezik:

     * 2 AMD XP 2600 MP CPU
     * MSI K7D Master-L DUAL MS-6501 alaplap
     * 4 1024MB PC2100 DDR REG ECC RAM
     * 1 40GB SEA 7200 Maxtor merevlemez
     * 2 120GB SEA 7200 Maxtor merevlemez
     * PIONEER DVR-AO5 IDE DVD-RW
     * 1.44mb floppy drive
     * ATI Expert 2000 Rage 128 32mb monitorvezérlõ kártya
     * IN-WIN P4 300ATX Mid torony ház
     * Intel PCI PRO-100 10/100Mbps hálózati kártya
     * 450W ENERMAX P4-430ATX tápegység
     * CREATIVE SB 128 5.1 PCI hangkártya

   2 db asztali számítógép az alábbi összeállítással rendelkezik:

     * 2 AMD XP 2600 MP CPU
     * MSI K7D Master-L DUAL MS-6501 alaplap
     * 2 512MB PC2100 DDR REG ECC RAM
     * 1 40GB SEA 7200 Maxtor merevlemez
     * 2 120GB SEA 7200 Maxtor merevlemez
     * MSI 52X24X52X CR52-A2 CD-RW
     * 1.44mb floppy drive
     * ATI Expert 2000 Rage 128 32mb monitorvezérlõ kártya
     * IN-WIN P4 300ATX Mid torony ház
     * Intel PCI PRO-100 10/100Mbps hálózati kártya
     * 450W ENERMAX P4-430ATX tápegység
     * CREATIVE SB 128 5.1 PCI hangkártya

   1 db asztali számítógép az alábbi összeállítással rendelkezik:

     * 2 AMD Palamino MP XP 2000+ 1.67 GHz CPU
     * Asus A7M266-D w/LAN Dual DDR
     * 2 Kingston 512mb PC2100 DDR-266MHz REG ECC RAM
     * Ricoh 32x12x10 CDRW/DVD Combo EIDE
     * 1 41 GB Maxtor 7200rpm ATA100 HD
     * 1 120 GB Maxtor 5400rpm ATA100 HD
     * 1.44mb floppy meghajtó
     * ATI Expert 2000 Rage 128 32mb
     * IN-WIN P4 300ATX Mid torony ház
     * Intel PCI PRO-100 10/100Mbps hálózati kártya
     * Enermax P4-430ATX tápegység

   1 db asztali számítógép az alábbi összeállítással rendelkezik:

     * 2 Intel Xeon 1.7 GHz 256K 400FS
     * Supermicro P4DCE Dual Xeon alaplap
     * 4 256mb RAMBUS 184-Pin 800 MHz RAM
     * 2 120 GB Maxtor ATA/100 5400 RPM HD
     * 1 60 GB Maxtor ATA/100 7200 RPM HD
     * 52X Asus CD-A520 INT IDE CDROM
     * 1.4 MB floppy meghajtó
     * Leadtex 64 MB GF2 MX400 AGP
     * Creative SB LIVE Value PCI 5.1
     * Microsoft Natural billentyûzet
     * Microsoft Intellimouse Explorer
     * Supermicro SC760 nagy torony ház, 400W-os tápegységgel

   2 db asztali számítógép az alábbi összeállítással rendelkezik:

     * 2 AMD K7 1.2g/266 MP Socket A CPU
     * Tyan S2462NG Dual Socket A alaplap
     * 4 256mb PC2100 REG ECC DDR-266Mhz
     * 3 40 GB Maxtor UDMA/100 7200 RPM HD
     * 50X Asus CD-A520 INT IDE CDROM
     * 1.4 MB floppy meghajtó
     * Chaintech Geforce2 MX200 32mg AGP
     * Creative SB LIVE Value PCI
     * Microsoft Natural billenytûzet
     * Microsoft Intellimouse Explorer
     * nagy torony ház, 300W-os tápegységgel

   2 db asztali számítógép az alábbi összeállítással rendelkezik:

     * 2 Pentium III 1 GHz Intel CPU
     * Supermicro 370 DLE Dual PIII-FCPGA alaplap
     * 4 256 MB 168-pin PC133 Registered ECC Micron RAM
     * 3 40 GB Maxtor UDMA/100 7200 RPM HD
     * Asus CD-S500 50x CDROM
     * 1.4 MB floppy meghajtó
     * Jaton Nvidia TNT2 32mb PCI
     * Creative SB LIVE Value PCI
     * Microsoft Natural billentyûzet
     * Microsoft Intellimouse Explorer
     * nagy torony ház, 300W-os tápegységgel

   2 db asztali számítógép az alábbi összeállítással rendelkezik:

     * 2 Pentium III 1 GHz Intel CPU
     * Supermicro 370 DLE Dual PIII-FCPGA alaplap
     * 4 256 MB 168-pin PC133 Registered ECC Micron RAM
     * 3 40 GB Maxtor UDMA/100 7200 RPM HD
     * Mitsumi 8x/4x/32x CDRW
     * 1.4 MB floppy meghajtó
     * Jaton Nvidia TNT2 32mb PCI
     * Creative SB LIVE Value PCI
     * Microsoft Natural billentyûzet
     * Microsoft Intellimouse Explorer
     * nagy torony ház, 300W-os tápegységgel

   2 db asztali számítógép az alábbi összeállítással rendelkezik:

     * 2 Pentium III 1 GHz Intel CPU
     * Supermicro 370 DE6 Dual PIII-FCPGA alaplap
     * 4 256 MB 168-pin PC133 Registered ECC Micron RAM
     * 3 40 GB Maxtor UDMA/100 7200 RPM HD
     * Ricoh 32x12x10 CDRW/DVD Combo EIDE
     * Asus CD-A520 52x CDROM
     * 1.4 MB floppy meghajtó
     * Asus V7700 64mb GeForce2-GTS AGP monitorvezérlõ kártya
     * Creative SB Live Platinum 5.1 hangkártya
     * Microsoft Natural billentyûzet
     * Microsoft Intellimouse Explorer
     * nagy torony ház, 300W-os tápegységgel

   3 db asztali számítógép az alábbi összeállítással rendelkezik:

     * 2 Pentium III 1 GHz Intel CPU
     * Supermicro 370 DE6 Dual PIII-FCPGA alaplap
     * 4 256 MB 168-pin PC133 Registered ECC Micron RAM
     * 3 40 GB Maxtor UDMA/100 7200 RPM merevlemez
     * Ricoh 32x12x10 CDRW/DVD Combo EIDE
     * 1.4 MB floppy meghajtó
     * Asus V7700 64mb GeForce2-GTS AGP monitorvezérlõ kártya
     * Creative SB Live Platinum 5.1 hangkártya
     * Microsoft Natural billentyûzet
     * Microsoft Intellimouse Explorer
     * nagy torony ház, 300W-os tápegységgel

2.4 Tûzfal, átjáró hardver

   1 db tûzfal az alábbi összeállítással rendelkezik:

     * AMD Palamino XP 1700+ 1.47GHz CPU
     * MSI KT3 Ultra2 KT333 MS-6380E alaplap
     * 512 MB PC2100 DDR-266MHz DIMM RAM
     * 40GB Seagate 7200rpm ATA/100 merevlemez
     * Asus 52X CD-A520 INT IDE cdrom
     * 1.44 MB floppy meghajtó
     * ATI Expert 2000 Rage 128 32mb monitorvezérlõ kártya
     * 3 Intel Pro/1000T Gigabit Server ethernet kártya
     * 4U Black Rackmount acél ház

   1 átjáró (gateway) az alábbi összeállítással rendelkezik. Az átjáró
   tükrözése a tûzfalnak, arra az esetre, ha az összeomlana/elromlana.

     * AMD Palamino XP 1800+ 1.57GHz CPU
     * MSI KT3 Ultra2 KT333 MS-6380E alaplap
     * 512 MB PC2100 DDR-266MHz DIMM RAM
     * 40GB Seagate 7200rpm ATA/100 merevlemez
     * Asus 52X CD-A520 INT IDE cdrom
     * 1.44 MB floppy meghajtó
     * ATI Expert 2000 Rage 128 32mb monitorvezérlõ kártya
     * 3 Intel Pro/1000T Gigabit Server ethernet kártya
     * 4U Black Rackmount acél ház

2.5 Egyéb, kiegészítõ hardverek

   Biztonsági mentés:

     * 2 Sony 20/40 GB DSS4 SE LVD DAT drives

   Monitorok:

     * 2 17" Viewsonic VE700 LCD monitor
     * 1 20.1" Viewsonic VP201M LCD monitor
     * 1 22" Viewsonic P220F 0.25-0.27m monitor
     * 4 21" Sony CPD-G500 .24mm monitor
     * 2 18" Viewsonic VP181 LCD monitor
     * 1 17" Viewsonic VE170 LCD monitor
     * 2 Sun monitors

   Nyomtatók:

     * HP colour laserject 4600dn

2.6 "Kössünk össze mindent egymással" hardverek

   KVM monitor kapcsolókat használunk egy olcsó monitorral, hogy "lássuk"
   az összes gépet.

     * 15" .28dp XLN CTL Monitor
     * 3 Belkin Omniview 16-Port Pro Switches
     * Belkin Omniview 2-Port Switch
     * APC AR203 netshelter rack unit

   Ez egy jó megoldás, de azt hiszem nem feltétlenül szükséges. Amire
   szükségünk van, az egy kis hordozható monitor amely a PC hátára
   csatlakoztatható (stylus-al mûködik, mint a Palm). Nem tervezem több
   monitorkapcsoló illetve KVM kábelt használatát.

   A hálózat fontos:

     * 2 Netgear FS750NA 48 port/1 git network switch
     * 1 Netgear FSM750S 48 port/2 git network switch
     * 1 Netgear FS517TS 16 port/1 git network switch
     * 1 Netgear FS750NA 48 port network switch
     * 1 Netgear FS524 24 port network switch
     * 1 Cisco Catalyst 3448 XL Enterprise Edition 48 port network switch
     * 1 Netgear ME102NA Wireless Access Point
     * 1 Netgear MA401NA Wireless PCMCIA

2.7 Költségek

   A mi szállítónk a Hard Drives Northwest ( [4]http://www.hdnw.com).
   Minden számítási csomópontért a fürtünkben (a két processzort is
   beleértve) körülbelül 1500-2000 USD-t fizettünk adóval együtt. Az
   általános célunk az volt, hogy a költség 1000 USD alatt legyen
   processzoronként (beleértve az egyéb alkatrészek árát is).

3. Szoftver

3.1 Operációs rendszer: természetesen Linux!

   Az alábbi kerneleket és disztribúciókat használjuk:

     * Kernel 2.2.16-22, KRUD 7.0 disztribúció
     * Kernel 2.4.9-7, KRUD 7.2 disztribúció
     * Kernel 2.4.18-10, KRUD 7.3 disztribúció
     * Kernel 2.4.20-13.9, KRUD 9.0 disztribúció

   Ezek a disztribúciók jól mûködnek mióta a frissítéseket CD-n küldik
   és nem kell megbízni a külsõ hálózatban a frissítések beszerzéséhez.
   "Tisztábbnak" tûnnek mint a szokásos Red Hat disztribúciók és a
   beállítása nagyon stabil.

3.2 Hálózati szoftver

   A Shorewall 1.3.14a programot ( [5]http://www.shorewall.net)
   használjuk tûzfalnak.

3.3 Párhuzamos feldolgozó szoftver

   Mi a saját szoftverünket használjuk alkalmazások párhuzamosítására, de
   vannak tapasztalataink PVM-el és MPI-al. Szerintem ezeknek az elõre
   csomagolt programoknak az többletterhelése túl nagy. Azt ajánlom írjál
   alkalmazás specifikus kódot a feladatodhoz (magánvélemény).

3.4 Költségek

   A Linux és a legtöbb szoftver ami Linux rendszeren fut ingyen
   másolható.

4. Telepítés, beállítás és üzemeltetés

4.1 A merevlemez beállítása

   Ez a fejezet a merevlemez-partícionálási stratégiát írja le.

fürtözött gépek:

hda1 - swap   (2 * RAM)
hda2 - /      (maradék hely)
hdb1 - /maxa  (teljes lemez)

asztali számítógép (windows nélkül):

hda1 - swap   (2 * RAM)
hda2 - /      (4 GB)
hda3 - /spare (maradék hely)
hdb1 - /maxa  (teljes lemez)
hdd1 - /maxb  (teljes lemez)

asztali számítógép (windows-szal):

hda1 - /win   (teljes disk)
hdb1 - swap   (2 * RAM)
hdb2 - /      (4 GB)
hdb3 - /spare (maradék hely)
hdd1 - /maxa  (teljes lemez)

laptop-ok (egy lemez):

hda1 - /win   (a teljes lemezméret fele)
hda2 - swap   (2 * RAM)
hda3 - /      (maradék hely)

4.2 Csomagok beállítása

   A fürt gépeire a csomagok minimális halmazát telepítettük. A
   felhasználóknak megengedtük, hogy úgy konfigurálják az asztali
   számítógépeket, ahogy akarják.

4.3 Operációs rendszer telepítése és karbantartása

  Csomagok klónozása és karbantartása

  FAI

   Az FAI ( [6]http://www.informatik.uni-koeln.de/fai/) egy automatizált
   rendszer, amely Debian GNU/Linux operációs rendszer telepítésére
   használható PC fürtökön. Veszel egy vagy több szûz PC-t, bekapcsolod
   és néhány perc múlva a Linux fel van telepítve és be van állítva,
   futtatása az egész fürtön semmilyen beavatkozást nem igényel.

  SystemImager

   A SystemImager ( [7]http://systemimager.org) egy szoftver, ami
   automatizálja a Linux és szoftverek telepítését és a termelés
   beindítását.

  Egyéni klónozási stratégia

   Van egy teljesen elosztott rendszerünk. Ezt azt jelenti, hogy minden
   gép az operációs rendszer egy példányát tartalmazza. Az operációs
   rendszert minden gépre manuálisan telepíteni kényelmetlen. A telepítés
   optimalizálásához elõször egy gépet telepítettem és állítottam be
   pontosan úgy, ahogy akartam. Aztán készítettem egy tömörített tar
   állományt az egész rendszerrõl amit egy CD-ROM-on helyeztem el. Végül
   errõl klónoztam minden gépet a fürtben.

   A tar állomány készítésére az alábbi utasítást használtam:

tar -czvlps --same-owner --atime-preserve -f /maxa/slash.tgz /

   Egy go nevû szkriptet használok, ami veszi a hosztnevet és az IP
   címet mint argumentumot, és kicsomagolja a slash.tgz állományt a
   CD-ROM-ról, majd lecseréli a hosztnevet és az IP címet a megfelelõ
   helyeken. A go szkript és bemeneti állományai elérhetõek a
   [8]http://www.ram.org/computing/linux/linux/cluster/ címen. Ezt a
   szkriptet módosítani kell a TE fürtöd felépítésednek megfelelõen.

   A Tom's Root Boot csomagot is használom ( [9]http://www.toms.net/rb/)
   arra, hogy indítsam a gépet és klónozzam a rendszert. A go szkriptet
   el lehet helyezni a CD-ROM-on vagy egy floppy lemezen ami a Tom's Root
   Boot csomagot is tartalmazza. (törölhetsz néhány programot ebbõl a
   csomagból, ha kifutsz a floppy lemez kapacitásából).

   Még kényelmesebb, ha készítesz egy indító CD-ROM-ot ami a Tom's Root
   Boot csomagot és a go szkriptet, valamint a klónozni kívánt rendszer
   tar állományát tartalmazza. Módosíthatod a Tom's Root Boot csomag
   inicializáló szkriptjét, hogy a go szkriptet futtassa (mindig be kell
   majd állítanod az IP címet, ha nem használsz DHCP szolgáltatást).

   Egy alternatív lehetõség, hogy készítesz egy saját indító lemezt
   (mint egy mentõ lemez), amely tetszésed szerinti kernelt és
   programokat tartalmaz. Számos dokumentum létezik, ami leírja ezek
   készítésének módját. A Linux Bootdisk HOWTO (
   [10]http://www.linuxdoc.org/HOWTO/Bootdisk-HOWTO/) is tartalmaz
   hivatkozásokat más elõre gyártott boot/root lemezekre.

   Így kifejleszthetsz egy rendszert ahol az összes dolog amit tenned
   kell csak annyi, hogy behelyezed a CD-ROM-ot bekapcsolod a gépet,
   veszel egy csésze kávét (vagy sütit) és visszajössz megnézni a kész
   klónt. Ezt az eljárást ismételheted annyiszor, ahány géped van. Ez az
   eljárás nagyon jól mûködik nekem és ha van valaki aki beteszi és
   kiveszi a CD-ROM-okat akkor még jobb.

   Rob Fantini ( [11]rob@fantinibakery.com) módosította a fenti
   szkriptet, Mandrake 8.2 rendszer klónozásához. Ez elérhetõ a
   [12]http://www.ram.org/computing/linux/cluster/fantini_contribution.tg
   z címen.

   Jelenleg egy olyan rendszeren dolgozok, amelyikben minden egy CD
   lemezre van felrakva, errõl indul a gép és könnyen klónozható. A
   közeljövõben közzéteszem a módszert.

  DHCP vagy beégetett IP cím?

   Ha van egy mûködõ DHCP szolgáltatásod, akkor nem szükséges újra
   beállítanod az IP címet és ezt a részt törölheted a go szkriptbõl.

   A DHCP elõnye, hogy nem kell vacakolnod az IP címekkel mert a
   megfelelõen beállított DHCP szerver szolgáltatja azokat. Egy
   hátránya, hogy egy központi szerveren van megvalósítva (és ahogy
   mondtam azon vagyok hogy elosszam a dolgokat amennyire csak lehet). Az
   IP címek hardver ethernet címekhez való kötése is kellemetlen lehet,
   amennyiben a gépet vagy a hosztnév cserét a szokásos módon kívánod
   végrehajtani.

4.4 Ismert hardver problémák

   A hardverek általában tényleg igazán jól mûködtek. Specifikus
   kérdéseket az alábbiakban sorolunk fel:

   Az AMD dual 1.2 GHz gépek igazán melegszenek mûködés közben. Kettõ
   már érezhetõen növeli a szoba hõmérsékletét. Míg jók lehetnek
   asztali számítógépekhez, de a hûtés és az energia fogyasztás
   megfontolandó, amikor nagy fürtök részeként használjuk õket. A
   korábban bemutatott AMD Palmino konfiguráció igazán jól mûködik, de
   azt ajánlom vegyél két ventilátort minden esetben, ez megoldotta az
   összes instabilitás problémánkat.

4.5 Ismert szoftver problémák

   Néhány tar program nem úgy készíti el a tar állományt, ahogy azt
   elvárnánk (különösen a szimbolikus hivatkozások visszafejtésében
   mutatkozik ez meg). A megoldás, hogy használj olyan tar programot, ami
   jól csinálja, például a Red Hat 7.0 disztribúcióban lévõt.

5. Feladat végrehajtás a fürtön

   Ez a fejezet úgy fejlõdik ahogy a fürtöm használata alakul. Eddig
   azon voltam, hogy megírjam a saját üzenet küldõ eljárásaimat,
   amellyel különbözõ gépeken futó processzek kommunikálnak egymással.

   Sok alkalmazás - különösen a számítógépes genomika területén -
   masszívan és könnyen párhuzamosítható. Ez azt jelenti, hogy jó
   elosztás érhetõ el azáltal, hogy azonos feladatokat szórunk szét a
   gépek között (például amikor a teljes genomot analizáljuk azt a
   technikát használjuk, ami egy génen, proteinen dolgozik és minden
   processzor egy génen, proteinen dolgozhat idõben, függetlenül a többi
   processzortól).

   Eddig nem kellet használunk profi queue rendszereket, de ez
   nyilvánvalóan erõsen függ a futtatni kívánt alkalmazástól.

5.1 Durva teljesítményteszt

   Egyszerûen a legfontosabb programot futtattuk (a mi ab initio
   protenin folding szimulációs programunkat) egy Pentium 3 1GHz
   processzoros gépen referenciának. A következõ eredmények születtek:

Athlon 1.2 GHz processzor körülbelül 16% gyorsabb
Xeon   1.7 GHz processzor körülbelül 27% gyorsabb
Athlon 1.5 GHz processzor körülbelül 38% gyorsabb
Athlon 1.7 GHz processzor körülbelül 46% gyorsabb
Xeon   2.4 GHz processzor körülbelül 62% gyorsabb

   Igen, az Athlon 1.5 GHz gyorsabb, mint a Xeon 1.7-es mivel a Xeon csak
   hat utasítás per órajelet (IPC), míg az Athlon kilenc órajelet futtat
   (számolj!).

5.2 Folyamatos üzemidõ (uptime)

   A gépek, mind hardver, mind szoftver tekintetben hihetetlenül
   stabilnak bizonyultak. Egyszer lettek debuggolva (rendszerint az új
   gépek közül néhány hardver problémával érkezik) folyamatosan nagyon
   nagy terhelés alatt. Egy példa látható alul. Újraindítások általában
   akkor történnek, amikor elektromos zavar keletkezik.

  2:29pm  up 495 days,  1:04,  2 users,  load average: 4.85, 7.15, 7.72

6. Köszönetnyilvánítás

   A következõ személyek segítettek ennek a HOGYANnak az elkészítésében:

     * Michael Levitt ( [13]Michael Levitt)

7. Irodalomjegyzék

   Az alábbi dokumentumok hasznosak lehetnek - ezek referenciák olyan
   forrásokra, amelyek a nagy teljesítményû fürtök használatával
   foglalkoznak:

     * [14]RAMBIN web page
     * [15]RAMP web page
     * [16]Ram Samudrala's research page (ebben a HOGYANban leírt fürttel
       elért néhány kutatási eredményt ír le)

8. Magyar fordítás

   A magyar fordítást [17]Szalai Ferenc készítette (2003.05.19). A
   lektorálást [18]Daczi László végezte el (2003.05.21). Bármilyen
   fordítással kapcsolatos észrevételt a [19]linuxhowto@sch.bme.hu címre
   küldjetek. Eme dokumentum legfrissebb változata megtalálható a
   [20]Magyar Linux Dokumentációs Projekt honlapján. A fordítás javítva
   2003.05.26.-án.

References

   1. http://compbio.washington.edu/
   2. http://www.ram.org/computing/linux/linux_cluster.html
   3. file://localhost/home/dacas/temp/Cluster-HOWTO-hu.html#known_hardware_issues
   4. http://www.hdnw.com/
   5. http://www.shorewall.net/
   6. http://www.informatik.uni-koeln.de/fai/
   7. http://systemimager.org/
   8. http://www.ram.org/computing/linux/cluster/
   9. http://www.toms.net/rb/
  10. http://www.linuxdoc.org/HOWTO/Bootdisk-HOWTO/
  11. mailto:rob@fantinibakery.com
  12. http://www.ram.org/computing/linux/cluster/fantini_contribution.tgz
  13. mailto:michael.levitt@stanford.edu
  14. http://www.ram.org/computing/rambin/rambin.html
  15. http://www.ram.org/computing/ramp/ramp.html
  16. http://www.ram.org/research/research.html
  17. mailto:szferi@angel.elte.hu_NO_SPAM
  18. mailto:dacas@freemail.hu_NO_SPAM
  19. mailto:linuxhowto@sch.bme.hu_NO_SPAM
  20. http://tldp.fsf.hu/index.html